Druga już edycja Nocy Kościołów odbyła się w dniach 25 - 27 czerwca. Większość wydarzeń religijno-artystycznych odbywała się we Wrocławiu, jednakże nie zabrakło też atrakcji w Świdnicy i Henrykowie, który raz pierwszy włączył się w to przedsięwzięcie.
Organizatorzy oprócz ciekawych wykładów i paneli dyskusyjnych, wystaw i koncertów muzyki klasycznej udostępnili zwiedzającym wiele niezwykłych i na co dzień niedostępnych miejsc. Zainteresowani mogli podziwiać piękno architektury sakralnej podczas nocy otwartych drzwi w kościołach i klasztorach.
Cykl unikatowych wydarzeń w piątkowe popołudnie rozpoczął metropolita wrocławski arcybiskup Marian Gołębiewski mszą świętą w Bazylice Garnizonowej św. Elżbiety we Wrocławiu. Przez trzy dni i noce w trzech dolnośląskich miastach oprócz nabożeństw odbywały się przedsięwzięcia zorganizowane w ramach promocji kultury i dialogu wspólnej Europy, w których uczestniczyli goście z Włoch, Ukrainy, Pakistanu, Białorusi i Indii.
Wrocławską Noc Kościołów rozpoczęły wykłady, panele i koncerty odbywane jednocześnie w różnych kościołach. Pierwsze wykłady poprowadzili Aleksander Milinkiewicz, lider białoruskiej opozycji nt. „Drogi do wolności i demokracji” oraz biskup Joseph Coutts z Pakistanu nt. prześladowań chrześcijan w XXI wieku. Odbyły się też panele dyskusyjne pt. „Prawda i kłamstwo o inkwizycji”, „Dolny Śląsk – moja Ojczyzna” oraz „Kresy Wschodnie – zapomniane dziedzictwo.”
W piątkowy wieczór można było również wysłuchać koncertu symfonicznego „Stworzenie świata” w wykonaniu Orkiestry Symfonicznej Filharmonii Dolnośląskiej i Chóru Uniwersytetu Wrocławskiego Gaudium oraz kwartetu smyczkowego „Metropolia” i wziąć udział w koncercie połączonym z kwestą na rzecz sierocińca w Indiach, którą poprowadził biskup Moses Prakasam oraz uczestniczyć w recitalu wybitnego skrzypka o międzynarodowej sławie Krzysztofa Jakowicza, a także wysłuchać koncertu muzyki włoskiej bądź chóru z Białorusi.
Pierwszą Noc Kościołów zakończyło nocne zwiedzanie klasztorów Sióstr Urszulanek oraz barokowych wnętrz klasztornych, Mauzoleum Piastów Śląskich, krypt i wirydarza klasztornego. Największą atrakcją wieczoru była Procesja Świętojańska ulicami Wrocławia nocą z pochodniami.
Sobotnią Noc Kościołów rozpoczęły panele dyskusyjne we wrocławskich świątyniach. O kościele i wolnym rynku dyskutowali prezydent Wrocławia Rafał Dutkiewicz, Stanisław Michalkiewicz oraz Tomasz Cukiernik z Instytutu Globalizacji. W Katedrze grekokatolickiej poruszono temat ikony w tradycji chrześcijańskiej. W dwóch innych kościołach odbyły się wykłady nt. „Chrystianofobii w Europie" i "Końca świata w 2012 roku”.
Dodatkowo w sobotnią noc można było wysłuchać koncertu Orkiestry Symfonicznej Filharmonii Dolnośląskiej lub Chóru Katedralnego, koncertu muzyki gospel bądź muzyki włoskiej, a także obejrzeć spektakl „Mozart listy pisze” w wykonaniu Wrocławskiego Spektaklu Lalek. Wrocław zafundował też wszystkim wiernym Strefy Full Miłosierdzia, gdzie spowiadali biskupi a także wielki jarmark produktów klasztornych.
Weekend nocy kościelnych w Świdnicy rozpoczął wykład nt. Chrystianofobii w Europie i koncert muzyki włoskiej. W sobotę odbyła się mszą święta w intencji Polaków mieszkających na Kresach Wschodnich a także wykład poświęcony prześladowaniom chrześcijan w XXI wieku. Świdnickie Noce Kościołów zakończył Koncert chóru białoruskiego i recital skrzypcowy Krzysztofa Jakowicza.
Prawdziwą duchową ucztę nocą wszystkim zwiedzającym zafundował Henryków, który udostępnił poszukującym chwil wyciszenia, Kościół Cysterski, Klasztor Księgi Henrykowskiej a nawet pustelnię kardynała Gulbinowicza. W niedzielę w Opactwie Pocysterskim założonym w 1228 roku, podczas Dni Księgi Henrykowskiej zwiedzający mogli podziwiać miejsce modłów zakonników na Śląsku, a w Dębowej Sali obejrzeć replikę księgi, a w niej pierwsze zdanie w języku polskim. Purpurowa Sala Opactwa zgromadziła uczestników panelu dyskusyjnego o tajemnicach klasztoru a henrykowska scena fanów zespołu Trubadurzy.